Здравствуйте, Наталья!
Срочный трудовой договор, заключенный на период исполнения обязанностей временно отсутствующего работника (за которым сохраняется рабочее место), в общем случае прекращается на дату выхода на работу такого сотрудника (ч. 3 ст. 79 ТК РФ).

Гарантии для беременной женщины, с которой расторгается срочный трудовой договор, прописаны в ст. 261 ТК РФ.

На основании ч. 3 ст. 261 ТК РФ, если такой договор был заключен именно с целью замещения временно отсутствующего сотрудника, работадатель обязан предложить Вам все имеющиеся вакантные должности (как соответствующие вашей квалификации, так  и нижестоящие), которые вы можете занимать по состоянию здоровья.

Если подходящая должность есть у работодателя и Вы согласны перейти на нее (согласие должно быть оформлено в письменном виде), то (ч. 2 ст. 261 ТК РФ, п. 27 постановления Пленума Верховного Суда РФ от 28.01.2014 № 1):

• оформляется перевод  на иную должность;
• предоставляется отпуск по беременности и родам;
• трудовой договор продлевается (путем оформления дополнительного соглашения к трудовому договору) до окончания декретного отпуска

Так, в случае рождения ребенка трудовой договор прекращается в день окончания отпуска по беременности и родам.

В случае, когда подходящие для перевода должности отсутствуют у работодателя или сотрудница отказалась от такого перевода, правомерно уволить беременную работницу (ч. 3 ст. 261 ТК РФ, п. 27 постановления Пленума Верховного Суда РФ от 28.01.2014 № 1).